井亭庙位于今新河镇境内的井亭村，有东井亭路、西井亭路地名。所谓“井亭”，指的是乡间道路旁所凿的井，以及所建的亭，有井有亭，是为“行人风雨思歇，疲渴思饮，暮夜思灯”。
雍正《崇明县志》地图中的“井亭”
崇明岛上旧时多“井亭”，有东井亭、中井亭、西井亭之区分。东井亭在箔沙四效。据雍正县志记载，“箔沙中区”下辖“井亭镇”，四效竖河有“井亭桥”，西距县城六十里。“井亭镇”今早已湮没，“井亭桥”今址在堡镇以东的南四效镇河西，至今仍保留“东井亭庙”、“东井亭桥”等老地名。《五效志》记载，东井亭庙相传建于清道光年间，同治年间改名为天后宫。东井亭桥相传建成于明末清初。据此推断旧志所载“井亭镇”即在此附近。
中井亭在竖新镇竖新村，原竖西村，靠近鹤颈湾，在陆福初宅附近，较为著称。崇明《朱氏家乘》卷首《印槐公墓志》，“墓在崇明中井亭北首茅养滨竖河东第八窕六号仙景沙”。崇明《徐氏家乘》“公正支、士奇后”的一支后代，“住中井亭”。
西井亭在新河镇西、第三条竖河东博济庵旁，清代杨元诏募建。杨元诏（1648—1729年以后），字植久，杨廷翰次子，杨家河镇人，侠义行善，训导张荣曾赠匾奖励。因康熙五十七年（1718）镇宪魏公巡行至此，目击时艰，雍正二年至七年（1724—1729），杨在第三条竖河东（今新河镇井亭村）博济庵旁募建义井、仁园（指义冢，俗称皇坟）。并撰《义井、仁园合记》一文。先是，杨与宋天球谋于施闇文，由施捐赀二十金；后明经黄廷仪、诸生黄遇六、里人沈允辉、节妇施氏各捐基地、修葺之费。另大理寺左评事沈能夏在庙旁捐地五百步筑义冢。传称“西北仁园仁及枯骨，东南义井恩被生民”。道光初年，井亭将圮，后又猝遭火废，道光二十七年（1847）由杨尚智重加整理。近代以来，该处井亭与庙（博济庵）合称井亭庙。1958年拆除井亭庙改建为井亭小学。至今村名“井亭村”即以此命名。
相传西井亭原为芦笆搭成的简易草屋，井洞口四面以干泥土垒高一尺，防止污水淌进去，另用芦叶水草编成一顶草帽盖在井口，防止污物掉到井里。后改建砖木结构的八角亭子，井栏改建为石圈栏，以保护水井不被污物脏水侵入井中。井亭庙仅有二间庙堂，一间供佛，一间诵念经文，庙内一尊菩萨被尊为井神或水神。上世纪，在建设乡村公路时，因井和井亭的位置都在规划红线内，于是先后拆除井亭，填平水井。
